Es el primer museo del Estado. En él descubrirás una gran historia a través de sus valiosas colecciones, que narran desde las manifestaciones culturales precolombinas hasta la promulgación de la Constitución de 1917. Se ubica en el Centro Histórico de Querétaro en lo que fuera el primer conjunto religioso de la ciudad.
Su destacada arquitectura virreinal, siete salas permanentes y galerías de pintura novohispana resguardan la memoria y el patrimonio queretano. 

Anillo con monograma de Maximiliano de Habsburgo.
Autor: Anónimo europeo.
Técnica: plata sobredorada con brillantes engarzados.
Medidas: 3.8 x 3.5 x 3.5 cm
Época: 1860
Ubicación: Sala Querétaro en la Historia Mexicana.

Anillo elaborado en plata sobredorada con el monograma de Maximiliano de Austria sobre un fondo esmaltado en color negro mate y circunscrito en una elipse formada por veintidós brillantes. En cada costado muestra el águila del Imperio Mexicano y entre ambas una guirnalda de laurel. Adicionalmente, tiene una inscripción cuya leyenda dice: Fernando Maximiliano Archiduc Austriac Natus in Sehúembrunn VI JULÜ MDCCCXXXII IMPERATOR Mexicanorum MDCCCLX.

San Pablo.
Autor: Cristóbal de Villalpando.
Técnica: óleo sobre tela.
Medidas: 220 x 130 cm
Época: finales del siglo XVII
Ubicación: Convento Grande de San Francisco.

Dentro de la colección pictórica destaca el apostolado pintado por uno de los artistas más importantes de la Nueva España: Cristóbal de Villalpando. Esta figura que representa al apóstol de los gentiles se muestra de medio cuerpo y con una rotunda solidez anatómica y expresiva claramente cercana a los modelos de Peter Paul Rubens.

Virgen Dolorosa.
Autor: taller novohispano, autor desconocido.
Técnica: escultura policromada.
Medidas: 144 x 53.5 x 45 cm
Época: segunda mitad del siglo XVIII.
Ubicación: Sala Magna.

Talla en madera policromada de gran destreza técnica y compositiva. Destaca lo robusto de la forma escultórica, el detalle y soltura de la vestimenta, así como la expresividad del rostro. A través de los distintos recursos artísticos, el artífice novohispano refuerza y logra transmitir el sentimiento de pena de la Virgen María durante la Pasión de Cristo.

Olla policroma.
Autor: cultura Tolteca.
Técnica: cerámica con decoración pseudo-cloissoné.
Medidas: 33 x 26 cm
Época: epiclásico (600-900 d.C.)
Ubicación: Sala Querétaro Prehispánico.

Proveniente del Cerro de la Cruz en San Juan del Río, Querétaro, es una pieza de excepcional belleza y destreza técnica de marcada influencia teotihuacana.

Linotipo (Linotype M.R.)
Manufactura: metal.
Marca y modelo: Mergenthaler Linotype Co. Modelo 5, número de serie 14216, New York, U.S.A.
Época: siglo XX
Ubicación: Sala Querétaro en la Historia Mexicana.

Querétaro formó parte fundamental de eventos de gran trascendencia para la Nación, entre los que destaca, la promulgación de la Carta Magna de 1917 y la impresión de las reformas constitucionales. Este linotipo hizo las líneas de texto para las columnas de todos los artículos de la recién creada Constitución lo que posibilitó su difusión al pueblo a través del bando constitucional expedido en esta ciudad bajo el gobierno de Federico Montes.